Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CACNB1Q02641 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CACNB1Q02641 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 557.8 ms