Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms