Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms