Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX8Q9Y5X2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms