Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB11Q9Y547 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms