Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms