Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNSTRNQ9Y448 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms