Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms