Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms