Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms