Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms