Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX7Q9UNH6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms