Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms