Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms