Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNL1Q9UK58 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms