Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MLH3Q9UHC1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH3Q9UHC1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms