Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms