Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms