Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms