Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms