Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms