Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms