Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms