Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZDHHC3Q9NYG2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms