Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms