Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4BQ9NT99 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms