Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDHAF3Q9NRP4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms