Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms