Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRPM3Q9HCF6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPM3Q9HCF6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms