Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms