Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms