Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms