Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms