Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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MAP1LC3CQ9BXW4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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MAP1LC3CQ9BXW4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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MAP1LC3CQ9BXW4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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MAP1LC3CQ9BXW4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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MAP1LC3CQ9BXW4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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MAP1LC3CQ9BXW4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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MAP1LC3CQ9BXW4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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MAP1LC3CQ9BXW4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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