Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms