Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms