Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms