Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIN2AQ99865 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms