Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms