Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms