Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms