Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms