Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms