Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms