Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCMH1Q96GD3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms