Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTV1Q96GA3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms