Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms