Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHMTQ93088 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms