Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF4Q8WV16 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms