Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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FAT3Q8TDW7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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FAT3Q8TDW7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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FAT3Q8TDW7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FAT3Q8TDW7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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